Margherita è Professore Associato presso il Dipartimento di Fisica del Politecnico di Milano e Visiting Professor presso la Princeton University. Ha conseguito il Dottorato di ricerca in Fisica nel 2014 presso il Politecnico di Milano, specializzandosi nel campo dell'ottica ultraveloce e della spettroscopia ultraveloce applicata alle biomolecole. Successivamente ha conseguito la prestigiosa Marie Curie Global Fellowship (2015) e ha lavorato presso l'Università di Princeton sulla spettroscopia elettronica multidimensionale ultraveloce. I suoi principali interessi di ricerca includono la comprensione della dinamica a femtosecondi dei meccanismi indotti dalla luce in sistemi biologici/bio-mimetici e nanostrutture ottiche. 
Il suo gruppo attualmente lavora sullo studio di sistemi complessi per la conversione dell'energia luminosa in sistemi molecolari, metasuperfici ottiche ultraveloci e interazioni forti luce-materia.
Ha pubblicato >100 articoli peer-reviewed, tra cui pubblicazioni su Science, Nature Photonics, Nature Chemistry, Nature Materials ed è stata invitata a presentare la sua ricerca a >30 conferenze internazionali e nazionali. Nel 2022 ha ottenuto un importante finanziamento europei ERC- Starting Grant (ULYSSES). Inoltre ha ricevuto ffinanziamenti nazionali (PRIN 2020, PRIN 2022, PRIN 2022 PNRR, Regione Lombardia) e internazionali (Marie Curie Training Networks e EIC-Pathfinder).
I risultati scientifici di Margherita hanno ricevuto prestigiosi riconoscimenti nazionali ed internazionali. Ha ricevuto il premio Early Career Women in Photonics (2023) della European Optical Society Prize, il Fresnel Prize della European Physical Society (2021) per i suoi "eccezionali risultati nella spettroscopia ottica ultraveloce, svelando i processi primari indotti dalla luce in biomolecole e nanostrutture con sub-10-fs", la "L'Oréal for Women in Science Fellowship" (2018) e il premio ENI - Debut in Research (2015).